首先，我们需要明确的是，在原作漫画或动画中，并没有明确描述卡卡西亲手杀害琳的情节。相反，琳的死是由赤砂之蝎的父亲——千代婆婆所造成的悲剧性事件。当时，琳作为晓组织的一员，被蝎误认为是敌人而遭到攻击。这场误会导致了琳的死亡，而卡卡西当时并不在现场，更没有参与这一事件。
然而，从另一个角度来看，卡卡西确实间接地影响了琳的命运。在第四次忍界大战期间，卡卡西作为忍联军的重要指挥官之一，与众多忍者并肩作战。而琳则以药师兜的身份回归战场，并成为了敌对阵营的一员。这种身份上的对立，使得两人之间的关系变得复杂且充满矛盾。
更为重要的是，卡卡西与琳之间存在着深厚的感情纽带。他们曾经同属第七班，是亲密无间的队友。特别是卡卡西与琳之间的感情超越了普通的师徒关系，但最终却因为战争和各自的选择而走向分离。当琳以敌人的姿态出现时，卡卡西内心充满了痛苦与挣扎，这也反映了他对于这段过往记忆的深刻怀念以及对琳逝去生命的深切哀悼。
综上所述，“旗木卡卡西为什么要杀了琳”这一问题的答案其实并不在于卡卡西本人是否真的实施了杀戮行为，而更多地体现了作品对于战争背景下人性复杂性的探讨。通过这些情节安排，《火影忍者》不仅塑造了更加立体的人物形象，也让观众感受到友情、爱情以及牺牲等主题所带来的震撼力量。
